Офицеру Рипли два раза удавалось противостоять космической твари, и дважды она успешно его убивала. Во время ее последней третьей битвы с чужим женщине удалось одолеть монстра, но это слишком дорого стоило для нее. Она убивает чудище, а следом за ним сама погибает. Две сотни лет прошло с той ужасной битвы и многие люди уже давно забыли о существовании кровожадных существ, зародившихся на планете ЛВ426.
Человеческая любознательность и прихоть не знает границ. Желание людей поиграть в богов может обернуться катастрофическими последствиями. Ученые в поисках ответов на то, что же произошло 200 лет назад с Эллен Рипли, клонируют ее. Девушка оживает, но помимо внешних данных сознание героини тоже переносится в новое тело. Клонировав погибшую, лаборанты помещают в ее физическую оболочку зародыш чужого. Иноземная тварь быстро растет и эволюционирует, а вскоре вылезает из Рипли.
На этот раз это не просто монстр, а гибрид чужого и человека. Пришелец быстро расправляется с учеными и военными, а затем начинает охоту на Элен. Пускай девушка всего лишь клон героини, но она имеет точно такие же способности, которые позволяют ей сойтись в смертельном поединке с чудовищем и дать ему достойный отпор.